Reflux v tomto kontexte znamená spätný návrat obsahu žalúdka. Je možné stretnúť sa s gastroezofageálnym refluxom, pri ktorom sa obsah žalúdka dostáva do pažeráka. Pažerák je na isté množstvo návratu žalúdočného obsahu pripravený, problémy sú pociťované až pri väčšom objeme refluxátu alebo pri jeho častejšom pôsobení. Často sa prejavuje pálením žáhy a pri dlhodobom pôsobení refluxátu sa môžu rozvinúť chronické zmeny sliznice pažeráka.

Pokiaľ sa však obsah žalúdka, aj keď len v nízkom objeme, vracia až do oblasti hrdla (hltan, hrtan, oblasť hlasiviek), tento stav voláme extraezofageálny (laryngofaryngeálny, horný) reflux. Prejavuje sa nešpecifickými ťažkosťami ako je pocit cudzieho telesa v hrdle, potreba odkašliavania, čistenia si hrdla či zmenami hlasu. Ide do istej miery o civilizačnú chorobu. Takýto reflux vieme diagnostikovať a nastaviť vhodnú liečbu.